Флаг Новотроицкого района утверждён решением районного совета от 25 ноября 1998 года. Полотнище имело длину вдвое больше, чем ширина.
Материалы книги "Украина. Гербы и флаги" (парлам. изд-во)
Новый вариант флага Новотроицкого района. утвержден решением районного Совета от 29 января 2015 года № 842. Пропорции полотнища - 2:3. Автор флага - А.Б. Гречило.
Рисунок взят с сайта интернет-магазина "Знаменосец" (продукция фирмы "Мон Джетта")
С 2022 года территорию района контролирует Российская Федерация. 4.10.2022 года подписан договор о присоединении Херсонской области к РФ. В составе области восстановлен Новотроицкий район. Также в муниципальной структуре создан "Новотроицкий муниципальный округ".