Флаг Злынковского района утвержден решением Злынковского районного совета народных депутатов от 30 января 2019 года № 55-9. Флаг муниципального образования Злынковский район внесен в Государтсвенный геральдический регистр РФ под № 13017. Описание флага:

"Зелёное прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее элементы герба муниципального образования Злынковский район Брянской области в красном, белом и жёлтом цветах".

Обоснование символики:
Флаг МО Злынковский район языком символов и аллегорий отражает исторические, культурные и экономические особенности МО Злынковский район.
Зеленый цвет полотнища символизирует природу, плодородие, жизнь, здоровье, надежду, радость, изобилие, возрождение, а также аллегорически указывает на зелёные лесные массивы и плодородные луга, которыми богаты земли района.
Изображение красной кирпичной кладки аллегорически напоминает о том, что злынковцы некогда славились каменщиками, которые ценились во всей Российской империи.
Красный цвет и дубовые ветви также аллегорически указывают на партизанское движение против оккупантов, на землях сегодняшнего района, на пролитую кровь патриотов в годы Великой Отечественной войны.
Красный цвет символизирует красоту, отвагу, мужество.
Дубовые ветви также символизирует крепость духа, мужество и славу защитников родной земли.
Изображение веток дуба также подчёркивает значение леса. Именно дуб составляет основную часть лесных массивов района. Ветки дуба также указывают и на природную достопримечательность района – многовековой дуб, расположенный в административном центре района - городе Злынка.
Жёлтый цвет символизирует богатство, процветание и прочность, а также просвещение и мудрость.
Пшеничные колосья символизируют сельскохозяйственную составляющую экономики района, основой которой является выращивание зерновых. Шесть колосьев аллегорически указывают на количество муниципальных поселений в составе района.
Трёхлистный крест в сиянии символизирует многочисленные направления православия, которое исповедую жители Злынковского района.
Изображение стилизованного орнамента в виде композиции из геральдических лилий и водных листьев аллегорически указывает на оригинальную деревянную резьбу с разнообразными хитросплетениями узоров, выполняемую местными умельцами, как в прошлые столетия, так и в настоящее время.
Белый цвет – символ мирных взглядов, добра и щедрости.
Автор идеи флага, изображения и обоснования символики: Владимир Нагаевский (Тихорецк).

Источник - "ГЕРАЛЬДИКА.РУ". Текст документа присалан В. Пермяковым