В 2021 году Залесовский район (муниципальный район) преобразован в Залесовский муниципальный округ, как административно-территориальная единица район продолжил существовать.

Флаг Залесовского района утвержден Решением Совета депутатов Залесовского муниципального округа от 28 июня 2024 года № 46. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 15003. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище зеленого и красного цветов с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию из герба Залесовского муниципального округа, выполненную белым, синим и желтым цветами. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую".

Обоснование символики флага Залесовского муниципального округа.
Флаг Залесовского муниципального округа составлен на основании герба Залесовского муниципального округа и повторяет его символику, языком геральдических символов и аллегорий лаконично отражая его природные богатства и основной вид деятельности местного населения. Во все фигуры флага заложена многозначная символика.
Залесовский муниципальный округ расположен на северо-востоке Алтайского края. Административный центр — село Залесово, расположенное в 142 км к северо-востоку от города Барнаула.
С самого основания Залесовского муниципального округа (ранее района) главным занятием населения были сельскохозяйственные работы. Залесовская земля издавна славилась выращиванием и переработкой льна. В ноябре 1929 г. был сдан в эксплуатацию Залесовский льнозавод. В 1933-1934 годах производство льна-долгунца в районе значительно возросло и были построены льнозаводы в селах Черемушкино, Борисово. В 1935 году в районе был получен самый высокий урожай льна в стране. Цветки льна – символ сельского хозяйства и плодородия.
Геральдическая фигура – белая (серебряная) волнистая перевязь дополняет природную символику флага, обобщая то, что на территории Залесовского муниципального округа протекают реки: Чумыш, Бердь, Каменка, Урап, Татарка, Талица и еще 125 мелких речек, 223 ручья и 6 прудов; имеется около 60 озер, четыре из них являются памятниками природы: Верхнее Игнатьево, Красный Яр, Мало-Калтайское и Черное. Остальные озера, как правило, незначительны по площади и располагаются в пойме реки Чумыша.
Символика пчел в зеленой части флага символически многозначно указывает:
– пчеловодство – одно из направлений сельского хозяйства, развитого в округе. В недалеком прошлом здесь располагался совхоз «Притаежный», который занимался производством меда. На сегодняшний день пчеловодство в Залесовском муниципальном округе осуществляет свою деятельность формате личных подсобных хозяйств. Местные жители гордятся своим медом;
– пчеловодство – занятие традиционное, поэтому накопленный опыт и традиции, бережно хранятся и передаются местными жителями из поколения в поколение;
– пчела – символ трудолюбия, заботливости, коллективизма;
– на благоприятные природные и климатические условия для жизни населения и сельского хозяйства.
Зеленая часть флагасимволизирует природу Залесовского муниципального округа, его сельскохозяйственный уклад, а также это символ надежды, благополучия и здоровья.
Красная (червленая) часть флага символ справедливости, благородства и любовь к ближнему.
Таким образом, флаг Залесовского округа не только отражает его природу и основной вид деятельности местного населения, но также символизирует его историю, показывает связь поколений и бережное отношение местных жителей к своему прошлому.
Применённые во флаге цвета и металлы символизируют:
желтый цвет (золото) – символ высшей ценности, величия, богатства, урожая;
белый цвет (серебро) – символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения;
зеленый цвет – символ жизни, молодости, природы, роста, здоровья;
синий (лазоревый) цвет – символ чистого неба и водных богатствах района;
красный (червленый) цвет – символ жизненной силы, огня, труда, мужества и стойкости.

Авторская группа:
идея флага: Администрация Залесовского района;
геральдическая доработка: Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
обоснование символики: Екатерина Моченова (Москва).

По информации К. Мочёнова