Флаг Вилючанского наслега утвержден Решением Совета депутатов МО "Вилючанский наслег" от 28 апреля 2016 года № 26.

"Прямоугольное полотнище соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба сельского поселения "Вилючанский наслег" в синем, желтом, зеленом и белом цветах".

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11335.

Материалы геральдического архива В. Маркова

Решением наслежного Совета депутатов от 18.12.2019 года № 23 утверждены новые варианты герба и флага Вилючанского наслега. Новый флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13051.

В лазоревом поле с зелёной горой, обременённой серебряным стоящим и обернувшимся конем, четыре звёзды о четырех лучах в пояс, выше которой летящий в перевязь серебряный сокол с распростёртыми крыльями.

Материалы геральдического архива В. Маркова