Cельское поселение упразднено в 2023 году при преобразовании Мичуринского района в Мичуринский муниципальный округ.

Флаг Устьинского сельсовета утвержден решением Совета народных депутатов Устьинского сельсовета от 3 апреля 2015 года № 93 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 10372.

Описание флага:
"Прямоугольное двухстороннее полотнище белого цвета с отношением ширины к длине 2:3, с фигурами из герба Устьинского сельсовета, выполненные голубым, жёлтым, зелёным и малиновым цветами".
Обоснование символики флага Устьинского сельсовета.
Село Устье - одно из старейших сел Мичуринского района было основано в 1636-1637 годах. Появление села связано не только с именем Ивана Биркина, а так же с именем его сподвижника Михаила Спешнева, которые получили царский указ о сооружении укрепленной линии поперек Ногайской степной дороги. С целью обороны от набегов татар наряду с Устьинским казачьим станом было сооружено еще несколько оборонительных и сторожевых пунктов, и все их соединял так называемый "татарский вал", остатки которого сохранились и по сей день.
Земли Устьинского сельсовета расположены недалеко от места слияния рек Польной Воронеж; и Лесной Воронеж, образующих далее реку Воронеж. Устье этих двух рек дало название казачьему стану, а впоследствии и селу.
Символика флага Устьинского сельсовета многозначна:
- вилообразный крест - аллегория слияния двух рек (Польный Воронеж и Лесной Воронеж) и образование третьей реки (Воронеж).
- сабли - символ первых поселенцев и основателей села - донских и украинских казаков. Сабля - символ свободы, верности присяге, геройства. Сабля, лежащая в ножнах, - символ мира под охраной оружия.
- зеленый холм - символ "татарского" вала, построенного как оборонительное сооружение, и частично сохранившегося на территории поселения до наших дней.
- яблоневые цветки - символизируют красоту и плодородие здешних земель и сел, богатых садами. Два цветка - аллегория двух населенных пунктов, составляющих единое поселение (сел Устье и Борщевое.);
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
Жёлтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая.
Голубой (лазурь) цвет - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Зеленый цвет символизирует природу, молодость, здоровье и надежду.
Малиновый цвет (пурпур) - символ власти, славы, почета, благородства происхождения, древности.
Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (Химки), Сергей Янов (Малаховка);
художник: Ольга Салова (Москва);
компьютерный дизайн: Юлия Терещенко, Анна Гарсия (Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки), Сергей Янов (Малаховка).

Материалы сайта Союза геральдистов России.