Флаг Тойсинского СП утвержден решением Собрания депутатов Тойсинского сельского поселения от 12 февраля 2018 года № 2 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11782. Согласно тексту Положения о флаге:

"Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуру из герба Тойсинского сельского поселения, выполненные в желтом, красном и синем цвете".
Обоснование символики флага Тойсинского сельского поселения.
Флаг Тойсинского сельского поселения на основе герба Тойсинского сельского поселения и повторяет его символику.
В состав Тойсинского сельского поселения входят: село Тойси (административный центр) и деревни Булаково, Козловка, Малые Шихирданы, Новое Бахтиярово, Старое Ахпердино, Старые Тойси и Татарские Тимяши.
Основное направление производственной деятельности -животноводческо - зерноводческое, что символически показано золотым полем герба.
Извилистая реки Була - основная река поселения, символически обозначена полосой лазоревого (синего) цвета с изломом.
На территории Тойсинского сельского поселения расположен Государственный Природный Заповедник "Присурский", находящийся под защитой государства. Символом заповедника по праву является сурок - зверь норник, крупный грызун. Сурки живут семьями, имеют по несколько норок, которые соединены протоптанными звериными тропинками, где вся местность обитания зверей покрыта сложной системой нор и дорожек. Сурки запасливы и бережливы. Сурки-зверьки находятся в родственных и дружеских отношениях друг с другом. Сурок, стоящий под необычной главой, образно показывающей крышу дома, аллегорически показывают жителей поселения, где мирно уживаются татары и чуваши.
Тойсинское сельское поселение гордится своими уроженцами. Самыми известными далеко за пределами поселения, символически показанные золотыми звездами, стали:
- Кузнецов Павел Ефимович (д. Старые Тойси) - участник Великой Отечественной войны, в 1943 году отличился в боях за Киев, за что ему 10 января 1944 года было присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали "Золотая Звезда".
- четыре Героя Социалистического труда:
- Перепёлкин Илларион Евдокимович (д. Старые Тойси) - участник Великой Отечественной войны, передовик производства, с 1933 года работал бригадиром полеводческой бригады колхоза "Гвардеец"; Указом Президиума Верховного Совета СССР от 19 марта 1948 года за получение высоких урожаев пшеницы присвоено звание Героя Социалистического Труда;
- Долгов Михаил Герасимович (д. Старые Тойси) - участник Великой Отечественной войны, в 1947 году, после демобилизации из армии, избран председателем колхоза "Гвардеец", которым руководил до 1968 года, являлся инициатором внедрения передовых приёмов агротехники, руководимое им хозяйство было известно высокими урожаями сельскохозяйственных культур и рентабельным животноводством, достижениями в механизации труда, Указом Президиума Верховного Совета СССР от 23 июня 1966 года за успехи в сельскохозяйствен. производстве присвоено звание Героя Социалистического Труда;
- Каргин Николай Васильевич (д.Старое Ахпердино) - одним из первых в области начал ухаживать за 500 свиньями на откорме; далее обслуживаемое поголовье довел до 600. Среднесуточный привес составлял 500-600 г.; за достигнутые успехи в развитии животноводства, новаторский труд и высокие показатели в производстве свинины Указом Президиума Верховного Совета СССР от 22 марта 1966 года присвоено звание Героя Социалистического Труда;
- Никитин Василий Антонович - большую часть жизни (1955 - 1973 гг.) работал в колхозе "Гвардеец" зоотехником, главным зоотехником, заместителем председателя колхоза, председателем колхоза (1968 - 1973гг.), за большие заслуги в развитии колхозного производства Указом Президиума Верховного Совета СССР от 8 апреля 1971 года удостоен звания Героя Социалистического Труда.
Применённые во флаге цвета символизируют:
Жёлтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения и интеллекта.
Красный цвет (червлень) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника.
Синий цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Авторская группа:
Идея флага, обоснование символики и художник: Мидхат Шакиров (д.Долгий Остров).
Компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва).
Геральдическая консультация: Константин Моченов (Химки).

По материалам сайта Союза геральдистов России