Некоторое время функции флага выполняло белое полотнище с изображением герба города. Такие флаги заказывались администрацией к различным праздникам.

По сообщению А.Куприна ("БИАР", г.Москва)

Флаг города Соль-Илецка утверждён 26 декабря 2007 года решением Совета депутатов муниципального образования городское поселение город Соль-Илецк № 209.

"Прямоугольное полотнище с соотношением сторон 2:3, состоящее из красной и синей горизонтальных полос. Ширина красной полосы в три раза больше ширины синей. На красной полосе у древка воспроизведены фигуры из герба муниципального образования городское поселение город Соль-Илецк: белая крепостная башня с открытыми воротами, в проеме которых жёлтая змея с лазоревыми глазами, обвившаяся вокруг жёлтой чаши с солью. Вдоль границы красной и синей полос изображены девять соприкасающихся белых ромбов".

При экспертизе в Геральдическом Совете при президенте РФ было рекомендовано изображение крепостных ворот поместить в центр полотнища. Указанные изменения приняты Решением Совета депутатов от 2 апреля 2008 года №236.

Обоснование символики флага: "В XVIII веке на месте нынешнего Соль-Илецка была основана крепость Илецкая Защита. Функцию защиты границы государства символизирует белая башня с зубцами, заимствованная из герба Соль-Илецка, утверждённого исполнительным комитетом городского Совета народных депутатов 23 апреля 1974 года. Чаша и змея традиционно считаются атрибутами древнегреческой богини здоровья Гигиеи, дочери легендарного прародителя медицины Асклепия. На флаге Соль-Илецка чаша и змея символизируют лечебные свойства местных озёр, их значение для здравоохранения области, курортный потенциал города. Красный цвет полотнища соответствует цвету флага Оренбургской области и символизирует принадлежность города к Оренбуржью. Белые ромбы символизируют кристаллы соли и перекликаются с ромбами в неутверждённом проекте герба для города Илецка, составленном Б. Кёне в середине XIX века. Синий цвет символизирует пресноводные реки Илек и Елшанку, а белые ромбы — насыщенную солью воду озера Развал".