Флаг Шологонского национального наслега утверждён Решением наслежного Совета депутатов № 97 от 27 октября 2010 года (несколько исправлялся экспертами Герсовета). Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 14231.

Прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Шологонский национальный наслег в зелёном, желтом и белом цветах.

Солнце – символ жизни, соболь обозначает пушной промысел, пояс – озеро Эйик.

По материалам геральдического архива В.Маркова