Постановлением Администрации сельского поселения Шеркалы от 25 октября 2017 года № 183 "О проведении конкурса рисунков "Символика для сельского поселения Шеркалы. Герб и флаг" были утверждены Положение о конкурсе, состав организационного комитета, состав конкурсной комиссии.

Флаг сельского поселения Шеркалы утвержден решением Совета депутатов сельского поселения Шеркалы от 15 февраля 2018 года № 236.

2.1. Описание флага сельского поселения Шеркалы гласит:
«Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры герба сельского поселения Шеркалы, выполненные белым, синим и красным цветом».
2.2. Рисунок флага сельского поселения Шеркалы приводится в Приложении 1 к настоящему Положению, являющемся неотъемлемой частью настоящего Положения.
2.3. Обоснование символики флага сельского поселения Шеркалы.
Флаг сельского поселения Шеркалы составлен на основе герба сельского поселения Шеркалы и повторяет его символику.
Шеркалы - это одно из древнейших поселений Западной Сибири. Судя по археологическим находкам, люди начали заселяться в этих местах уже более трех тысячелетий назад. Сначала таежные рыболовы и охотники облюбовали для поселения три живописных холма, омываемые с юго-запада Обью. В XII–XIV веках здесь жили не только предки современных ханты, но и древние коми, на их языке поселение называлось Шеркар, что означало «средний город»: уже в самом названии подчеркивается стратегическое преимущество его расположения. Не случайно археологи предполагают, что укрепленный городок Шеркар в средние века мог быть столицей Кодского хантыйского княжества. В XVI веке городище погибло в результате сильного пожара, люди устроили новое поселение уже непосредственно на обском берегу. Считается, что современное село было основано русскими первопроходцами в 1595 году на месте древнего поселения ханты (отчет Макаровой Г.И. заведующей Октябрьским филиалом Ханты-Мансийского окружного краеведческого музея).
Аллегория названия «средний город» передана равными делениями флага, волнистого пояса и фигуры национального хантыйского орнамента на две части переменных цветов.
Национальный узор «оленьи рога» – символизирует самобытную культуру местного коренного населения.
Река Обь символически показана волнистым поясом.
Солнце, встающее из-за реки алым (червленым) кругом, символизирует надежду на возрождение и просветление будущего.
Два осетра символизирует речные богатства, экологическую чистоту окрестностей поселения.
Чайка, летящая над волнами, символизирует свободу людей, живущих на берегу могучей реки и единство с природой.
Примененные во флаге цвета и металл дополняют его символику.
Белый цвет (серебро) – символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
Синий цвет (лазурь) – символ возвышенных устремлений, искренности, преданности.
Красный цвет (червленый) – символ мужества, труда, тепла, красоты и праздника.
2.4. Авторская группа.
Идея флага: Ольга Петрук (с.Шеркалы), Константин Моченов (Химки).
Художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва).
Обоснование символики: Ольга Петрук (с.Шеркалы), Константин Моченов (Химки).

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11776.

По сообщению В. Пермякова