Флаг Шенталинского района утвержден Решением Собрания представителей МР Шенталинский от 31 октября 2016 года № 86. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 11129. Описание флага:

2.1. Описание флага Шенталинского района:
"Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее изображение фигур герба Шенталинского муниципального района, выполненных в красном, жёлтом, голубом и зелёном цвете».
2.2. Рисунок флага Шенталинского района приводится в приложении 1, являющемся неотъемлемой частью настоящего Положения.
2.3. Обоснование символики флага Шенталинского района.
Символика флага Шенталинского района повторяет символику герба Шенталинского района, она едина и гармонична. Все фигуры символизируют благоприятные природные и климатические условия Шенталинского района для жизни населения, а колос, солнце, кайма вокруг флага показывают, что в основе своей район является сельскохозяйственным.
Колос показывает, что во всех хозяйствах занимаются возделыванием зерновых культур.
Возникающее солнце – символ творящего первоначала, являясь источником тепла, мира и согласия, изливает на землю поток жизнетворческих сил, а на людей - свою благодать.
Жёлтый цвет – это цвет солнца, скрытых сокровищ и богатства, зерна, плодородия, символизирует величие, уважение, великолепие.
Красный цвет говорит о трудолюбии жителей Шенталинского района и символизирует труд, жизнеутверждающую силу, мужество, праздник, красоту.
Березовые листья - символ плодородия, роста, обновления, символически отражают богатую природу Шенталинского района.
Зеленый цвет символизирует весну, здоровье, природу, молодость и надежду.
Голубая оконечность дополняет символику герба, и символизирует реку Черемшан, а также многочисленные малые реки.
Голубой цвет – символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
3.3. Авторская группа:
идея: Елена Михайлова (с. Каменка Шенталинского района), Гульфия Сафина (ст. Шентала) Константин Мочёнов (Химки),
обоснование символики: Галина Туник (Москва),
художник: Роберт Маланичев (Москва),
компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва).

По сообщению В. Пермякова