11 июня 2003 года был объявлен конкурс на лучший проект флага города Саяногорска (Решение Саяногорского городского Совета депутатов от 11.06.2003 г. №45) "О флаге города Саяногорска").

"Флаг муниципального образования город Саяногорск
Флаг муниципального образования город Саяногорск является официальным символом муниципального образования.
Флаг муниципального образования город Саяногорск представляет из себя прямоугольное полотнище, состоящее из трех полос. Две равновеликие полосы расположены горизонтально в последовательности: верхняя - желтого, нижняя - зеленого цвета. Третья полоса синего цвета шириной 1/6 длины флага расположена вертикально непосредственно у древка флага, объединяя горизонтальные полосы. В левой части желтой полосы флага расположены стилизованные изображения плотины и силуэта промышленного предприятия, пересекающие полотно флага. Оба символа синего цвета.
Стилизованное изображение плотины символизирует гидроэнергетику -первопричину образования города, силуэт промышленного предприятия внутри полушестерни символизирует индустриально-промышленное направление развития экономики города.
Желтая, зеленая и синяя полосы флага отображают географическое месторасположение: город находится на границе таежной и степной зон, на берегу реки Енисей.
Отношение ширины флага к его длине 2:3".

Материал получен от В.Попоски

29 сентября 2008 года Решением № 210 сессия Саяногорского городского совета депутатов утвердила новые герб и флаг города (с учетом рекомендаций Геральдического совета при президенте РФ). Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 4437. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из четырех горизонтальных полос, разделенных линиями в виде остроконечных волн: желтой, голубой, зеленой и желтой в соотношении средней ширины полос 3:1:1:3; по центру полотнища - вертикальная зеленая полоса в 1/5 длины полотнища, несущая в верхней части орнаментированный особым образом бело-голубой прямоугольник, а ниже - три меньших белых прямоугольника».
Обоснование символики флага города Саяногорска.
Флаг разработан на основе герба, который языком символов и аллегорий отражает экономические и природно-географические особенности Саяногорска.
Город Саяногорск, образованный из рабочего поселка Означенное, имеет богатую историю.
В окрестностях города обнаружены многочисленные археологические памятники, относящиеся к самым ранним появлениям человека на территории нашей страны. Здесь также обнаружены памятники эпохи Великого переселения народов, раннего средневековья.
Планомерное заселение этого края началось в XVIII столетии, а своим образованием и развитием город в основном обязан экономическим событиям середины ХХ века. Строительство Саяно-Шушенской ГЭС позволило создать Саянский промышленный узел - комплекс крупных промышленных предприятий. На флаге города градообразующая роль ГЭС отражена аллегорическим изображением плотины. Три серебряных бруска - формы для отливки алюминия указывают на Саяногорский алюминиевый завод, самый современный из российских алюминиевых заводов - второе градообразующее предприятие.
Волнистые полосы символизирует расположение Саяногорска на реке Енисей.
Зеленая вертикальная полоса поверх желтого поля указывает на расположение города на границе таежной и степной природно-климатических зон.
Желтое полотнище флага образно указывает на богатство земель окружающих город: с давних времен известно месторождение Саянского мрамора, еще в XVIII столетии была разведана медная руда.
Желтый цвет (золото) - символ богатства, стабильности, уважения, интеллекта.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Голубой цвет - символ чести, благородства, духовности, возвышенных устремлений.
Зеленый цвет - символ природы, здоровья, молодости, жизненного роста.
Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (Химки);
компьютерный дизайн: Галина Русанова (Москва);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково).

По сообщению М.В.Ревнивцева (по материалам справочной базы "Гарант")

У нас есть также фотография знамени Саяно-Шушенской ГЭС. На синем полотнище знамени приведено изображение ГЭС и корпоративные символы РАО ЕЭС.

Использована фотография знамени на сайте фирмы "Октябрь" - изготовителя знамени