Флаг ГП "Пустошка" утвержден решением Собрания депутатов городского поселения «Пустошка» от 28.04.2021 года № 29 и внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под № 13589. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, с распространением на всю его поверхность композиция герба городского поселения "Пустошка", выполненную зеленым, синим, желтым, белым, черным и красными цветами. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую".

Обоснование символики:
Флаг городского поселения "Пустошка" разработан на основе герба городского поселения "Пустошка" и повторяет его символику.
Флаг городского поселения "Пустошка" разработан на основе флага Пустошкинского района, что символизирует единство, общность интересов и нераздельность истории двух муниципальных образований.
Основой флага стало географическое расположение города Пустошка (названного так в связи со строительством железнодорожной станции на пустоши, выкупленной у крестьян деревни Звяги), на пересечении автомагистралей М 9 (Москва - Рига) и М 20 (Санкт-Петербург - Киев), символически изображенные в флаге двумя узкими поясами, пересеченными в крест.
Пустошка - важная железнодорожная станция на маршруте Москва-Рига, что в флаге символически показано традиционным для схем черно-серебряным поясом.
Аисты, гнездящиеся в этих местах, являются символом города. Аист символизирует мир, верность, заботу о потомстве и чистоту природы.
Лазурь (синий цвет) отражает тот факт, что Пустошка расположена на реке Крупея. Вокруг города расположены многочисленные озера. Лазурь - символ чистого неба, красоты и добродетели.
Зеленый цвет символизирует весну, здоровье, молодость и надежду.
Серебро (белый цвет) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
Золото (желтый цвет) - символ прочности, величия, богатства, интеллекта, великодушия.
Червлень (красный цвет) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника.
Черный цвет символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность и вечность бытия.

Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (Химки), Александр Фадеенков, Владимир Медведев (оба - Пустошка), Николай Сайков (Пустошкинский район);
художник: Роберт Маланичев (Москва);
компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева, Ольга Салова (обе - Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

Источник - ГЕРАЛЬДИКА.РУ