Сельское поселение Микулинское упразднено в 2019 году, одновременно с преобразованием Лотошинского муниципального района в городской округ Лотошино. На территории МО 38 было населенных пунктов. Центр муниципального образование село Микулино (Микулино-Городище).

Флаг Микулинского СП утвержден Решением Совета депутатов СП Микулинское от 13 июля 2007 года №68/14 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №3565. Согласно тексту Положения о флаге:

"3. Описание и обоснование символики флага сельского поселения Микулинское
3.1. Описание флага сельского поселения Микулинское:
"Полотнище с отношением ширины к длине 2:3, разделённое по вертикали на три равных полосы - красную, синюю и красную, и несущее по центру композицию из герба сельского поселения - руки, держащие символическую княжескую шапку в виде города, изображенные розовым, жёлтым, оранжевым, белым и серым цветами".
3.2. Обоснование символики флага сельского поселения Микулинское.
Флаг сельского поселения создан на основе его герба.
Село Микулино-Городище образовалось на рубеже Х - ХI столетий на территории Суздальского княжества. С ХIII столетия Микулино входило в состав Тверского княжества, а в XIV веке стало центром удельного княжества. Микулин окончательно превратился в удельный город, доставшись около 1341 г. в управление сыну Александра Михайловича - Михаилу, который фактически и стал первым удельным князем, сохранив за собою право на Микулинский стол и тогда, когда получил великое княжение. При Михаиле Александровиче был построен ныне действующий собор Михаила Архангела - достопримечательность городской архитектуры. Построенные церкви и два монастыря в XIV – ХV столетиях также являлись крепостями на границе Тверского и Московского княжеств. Композиция флага отражает богатое историческое прошлое Микулино: собор и крепостная стена, стоящие на меховой опушке, напоминают общими очертаниями княжескую шапку - символ власти и аллегорически отражают княжеский период истории сельского поселения. Символика голубой полосы - столба многозначна:
- Столб - символ опоры и надёжности, подчёркивает историческую важность Микулинской земли.
- Деление полотнища на части аллегорически показывает пограничное положение Микулин о на рубеже Московских и Тверских земель.
- Синий цвет столба аллегорически указывает на территориальную принадлежность Микулинского сельского поселения к Лотошинскому муниципальному району, основной цвет герба которого тоже синий.
Крепостная стена - символ самостоятельности, силы и независимости на флаге Микулино аллегорически отражает легенду, связанную с появлением Микулино: о богатыре Микуле Селяниновиче, который расчистил в дремучем лесу место и построил здесь город, названные потом его именем.
Руки, поддерживающие «шапку» символизируют главное богатство Микулинской земли во все времена - это её жители, которые приумножали и приумножают славу своей малой Родины.
Жёлтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения и интеллекта.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Синий цвет - символ чести, благородства, духовности и возвышенных устремлений.
Красный цвет - символ мужества, справедливости, силы, красоты и праздника.
3.5. Авторская группа:
идея флага: Константин Мочёнов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково)".

По материалам сайта "Союза геральдистов России" и справочной правовой базы "Гарант"