Флаг Майминского района утвержден Решением Совета депутатов МО от 23 декабря 2003 года №16-22 "Об утверждении положения о Флаге МО "Майминский район". Согласно тексту Положения о флаге:

"Флаг муниципального образования «Майминский район» представляет собой прямоугольное полотнище из четырех горизонтальных полос: верхняя - белого цвета, нижняя – светло-зеленого, узкие полосы - голубого и белого цветов. Отношение ширины флага к его длине 1:2.Соотношение полос составляет 1/4, 1/25 и 1/25 к ширине флага.
Два цвета флага муниципального образования «Майминский район» соответствуют цветам Государственного флага Республики Алтай и Государственного флага Российской Федерации и подчеркивают, что муниципальное образование «Майминский район» является неотъемлемой частью субъекта Республики Алтай в Российской Федерации.
Белые полосы олицетворяют вечность, стремление к возрождению, любви и согласию. Голубая полоса является символом чистоты, неба, рек и озер. Светло-зеленая полоса является символом чистоты природы, гор, экологии и воздуха.
Многоцветный рисунок флага муниципального образования «Майминский район» помещен в приложении №1 к настоящему положению".

Рисунок прислан В.Попоски (V.Poposki), текст Решения - В.Марковым; 2012 г.

Герб и флаг муниципального образования «Майминский район» Республики Алтай утверждены решением Майминского районного Совета депутатов № 14-5 от 26.12.2019 года. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 12847. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования «Майминский район» с заменой геральдических золота, серебра и лазури соответственно жёлтым, белым и голубым цветами".

Филин – представитель фауны. Ключ – «вход» в Горный Алтай. Две перевязи (гора) – горный ландшафт. Кайма й оконечности – река Катунь. Безант (солнце) – тепло и свет.

По информации В. Маркова. Текст документа прислан В. Пермяковым