Флаг Лузинского сельского поселения утвержден решением Совета Лузинского сельского поселения от 18 мая 2017 года № 10 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11376.

Описание флага «Прямоугольное двухстороннее полотнище зелёного цвета с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры из герба Лузинского сельского поселения, выполненные белым, красным и жёлтым цветом».
Обоснование символики флага Лузинского сельского поселения.
Символика флага Лузинского сельского поселения повторяет символику герба Лузинского сельского поселения.
Деревню Лузино основали в 1799 году крестьяне Абацкой слободы. В те далекие годы, два домика-казармы, были первым населенным пунктом на территории современного Лузинского сельского поселения.
Летом 1906 года Владимир Рудольфович Штейнгель обратился через своего временного поверенного Якова Онацкого в хозяйственное правление Сибирского казачьего войска с просьбой о сдаче ему в аренду на 24-летний срок девяти земельных участков площадью 17410 десятин. Ходатайство рассматривалось три года, пока не истек срок прежних арендных договоров. В 1909 г. барон Штейнгель получил в аренду сроком на 12 лет земли, на которые он претендовал. Среди них были участок № 96 (современное село Лузино) и участок № 97 (деревня Пятилетка). На этих землях Штейнгель организовал крупное хозяйство, специализировавшееся на коневодстве. Из Лузино лошади поставлялись в армию и продавались на местный рынок.
Конь - надёжный спутник человека в трудных походах и верный его помощник.
Попона, прикрывающая коня, символизирует защиту, хозяйскую заботу, уход.
Четыре звезды и два перекрещенных молотка украшающие попону, заимствованы из личного герба барона Штейнгеля - самого известного местного хозяйственника.
Жёлтая полоса в оконечности, словно бесконечная лента, уходящая за край щита, символизирует Западно-Сибирскую железную дорогу, проходящую через Лузинское сельское поселение.
Жёлтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
Зеленый цвет символизирует весну, здоровье, природу, молодость и надежду.
Красный цвет (червлень) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника.
Авторская группа:
Идея флага: Константин Моченов (Химки).
Художник и компьютерный дизайн: Анна Гарсия (Москва).
Обоснование символики: Игорь Шатин (Москва).

По материалам сайта Союза геральдистов России. Текст документа прислан В. Пермяковым.