Флаг Курганского сельского поселения утвержден Решением Совета Курганского сельского поселения от 24 ноября 2023 года № 31. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 14678. Описание флага:

"Прямоугольное желтое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры из герба Курганского сельского поселения, выполненные зеленым и желтым цветами.
Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую».

Обоснование символики флага Курганского сельского поселения.
Флаг Курганского сельского поселения составлен основе герба Курганского сельского поселения и повторяет его символику, языком геральдических символов и аллегорий лаконично отражая его название, административный состав и природные богатства. Во все фигуры герба заложена многозначная символика.
Курганское сельское поселение расположено на востоке Муромцевского района Омской области.
Курган – гласно указывает на название сельского поселения Курганское, что в геральдике является одним из классических способов создания герба – гласного герба. Зеленый курган – символ красоты природы окрестностей Курганского сельского поселения.
Глухарь в гербе Курганского сельского поселения символически указывает:
– символ богатой фауны здешних мест;
– символ мудрости, осторожности, процветания и благополучия, который хранит здоровье человека и отпугивает от него злых духов.
– в символике Курганского сельского поселения глухарь перекликается с гербом Муромцевского района, из которого заимствован образ глухаря, что символизирует неразрывность истории и общность территории двух муниципальных образований;
Символика сосновых шишек многозначна:
– символически отражает сохраненные лесные массивы Курганского сельского поселения, включая сосновый бор и биологическое разнообразие природы сельского поселения, в том числе богатый животный мир и одно из красивейших ландшафтов России.
– Курганское сельское поселение состоит из пяти населенных пунктов: село Курганка (административный центр), деревни Казанка, Колобово, Малинкино и поселок Льнозавод, что аллегорически показано в виде пяти сосновых шишек;
Золотое (желтое) поле герба – символ сельского хозяйства, которое благодаря трудолюбию и энтузиазму местных жителей развивалось. Золото– символ высшей ценности, величия, достатка, стабильности, интеллекта.
Зеленый цвет – символически показывает основное богатство Курганского сельского поселения – лес. Зеленый цвет – символ плодородия, обновления, природы и экологии, здоровья, молодости, надежды и жизненного роста.
Чередование золотого и зелёных частей и фигур флага аллегорически характеризует созидательную человеческую деятельность, направленную на преобразование природы и в то же время находящуюся в тесной и гармоничной взаимосвязи с ней.
Таким образом, флаг Курганского сельского поселения не только отражает его название, но также символизирует его состав и природу, показывая связь поколений и бережное отношение местных жителей к своей истории.
Авторская группа:
идея флага: Денис Казанцев (с.Курганка-Омск), Константин Моченов (Химки), при участии Сергея Речкина (с.Курганка);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
обоснование символики: Екатерина Моченова(Москва).

По информации К. Моченова