10 сентября 2004 года рабочий посёлок Старая Купавна по постановлению №198-ПГ губернатора Московской области был преобразован в город Старая Купавна. Муниципальное образование упразднено в 2018 году в связи с преобразованием бывшего Ногинского муниципального района в Богородский городской округ.

Существует и используется в города флаг, созданный на основе герба поселка Старая Купавна, утвержденного 23 октября 1986 года. Видимо, флаг неофициальный.

Источник фото - официальный сайт Старой Купавны (фото на "Маршруте памяти", май 2013 г.). Рисунок - реконструкция "Вексиллографии"

Флаг Старой Купавны утверждён Решением Совета депутатов муниципального образования "Город Старая Купавна Московской области" от 26 октября 2016 года № 4/51па-2016 "О флаге муниципального образования "Город Старая Купавна Московской области". Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11188.

Статья 2. Описание и обоснование символики ФЛАГА
2.1. Описание ФЛАГА:
ФЛАГ представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, разделенное по горизонтали на красную и синюю полосы, несущее в центре изображение фигур герба городского поселения Старая Купавна».
2.2. Обоснование символики ФЛАГА:
ФЛАГ разработан на основе герба и повторяет значение его символики.
Символика ГЕРБА многозначна и отражает прошлое и настоящее поселения:
- большой цветок купавки (купавы) – водяной цветок, которым изобиловала река Купавинка, созвучный с названием поселения;
- сквозные ромбы (геральдические веретена) символизируют развитость текстильного производства. Ромб - веретено также отражает связь городского поселения с Ногинским районом, в гербе которого шесть сквозных ромбов;
- красный цвет - символ мужества, красоты, мастерства, трудолюбия;
- синий цвет – символ чистого неба и водных просторов; указывает на реку Купавинка, по имени которой названо городское поселение;
- желтый цвет (золото) - символ богатства, стабильности, уважения и интеллекта.
2.3. Авторская группа:
идея ГЕРБА: Игорь Сметанников (Монино), Олег Агафонов (Москва);
геральдическая доработка: Константин Моченов (Химки);
художник: Оксана Афанасьева (Москва);
компьютерный дизайн: Анна Гарсия (Москва);
обоснование символики: Олег Агафонов (Москва).

По сообщению В. Пермякова