Флаг Кумторкалинского района утвержден решением Собрания депутатов муниципального района "Кумторкалинский район" от 16.05.2023 №13-VII-СД. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под № 14354. Описание флага:

"Прямоугольное синее полотнище, с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры из герба Кумторкалинского района, выполненные зеленым и желтым цветами. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую".

Обоснование символики флага Кумторкалинского района.
Флаг Кумторкалинского района составлен на основании герба Кумторкалинского района и повторяет его символику, языком геральдических символов и аллегорий лаконично отражая географическое расположение и основной вид деятельности местного населения. Во все фигуры флага заложена многозначная символика.
Символика орла многозначна:
– являясь символом скорости, стремления к новым вершинам, достижения целей, орел показывает Кумторкалинский район - перспективный и быстроразвивающийся;
– орел – символ разнообразия и богатства животного мира Кумторкалинского района;
– орел символизирует сохранение традиций, преемственность поколений, бережное отношение местных жителей к культуре коренного населения района.
Жемчужиной Кумторкалинского района является заповедник Бархан «Сарихум» – удивительный по красоте место и неожиданный для встреч с прекрасным миром живой природы. Самое жаркое место в Российской Федерации - Бархан «Сарихум» - высочайшая одиночная песчаная гора в мире. Бархан расположен у подножья предгорий на Тереко-Сулакской низменности, южные склоны бархана обращены к Кумторкалинскому хребту, северные и восточные склоны переходят в низменность. Бархан имеет около 10 км в длину и 3 км в ширину, высота от 213 до 273 метров, площадь до 30 кв.км.
Зеленая полоса в оконечности флага символизирует природу района, его сельскохозяйственный уклад, а также это символ надежды, благополучия и здоровья.
Долины, защищенные горами, обеспечивают здешние места мягким климатом, который благоприятен для разведения виноградников. Виноградные лозы, положенные накрест символизируют неразрывную многовековую связь истории из глубины веков до настоящего времени. Гроздь винограда - символ плодородия и изобилия, единства, гостеприимства, щедрости и обобщенная аллегория сельского хозяйства района.
Лазоревый (синий) цвет - символ чистого неба и водных богатствах района – район имеет береговую линию Каспийского моря, а также славен естественными родниками Богатыр-булакъ, Къарасув-Булакъ и минеральным источником «Къычыв сув».
Таким образом, флаг Кумторкалинского района не только отражает его природу и основной профиль деятельности местного населения, но также символизирует его историю, показывает связь поколений и бережное отношение местных жителей к своему прошлому.
Примененные во флаге цвета и металл дополняют его символику:
желтый цвет (золото) – символ высшей ценности, величия, богатства, стабильности и урожая;
зеленый цвет – символ природы, здоровья, молодости, надежды и жизненного роста;
синий цвет (¬лазурь) – символ искренности, чести, славы, преданности, истины и добродетели.

Авторская группа:
идея флага: Администрация Кумторкалинского района, (Магомед Ибраков (с. Коркмаскала);
геральдическая доработка: Константин Моченов (Химки);
художник: Оксана Афанасьева, Ольга Салова (обе – Москва);
компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
обоснование символики: Екатерина Моченова (Москва).

По информации К.Ф. Мочёнова, Союз геральдистов России