Флаг Красноярского СП утвержден Решением Совета депутатов МО "Красноярское сельское поселение" от 5 ноября 2013 года №9/3. Согласно тексту Положения о флаге:

"2.1. Описание флага Красноярского сельского поселения:
«Прямоугольное двухстороннее полотнище голубого цвета с отношением ширины к длине 2:3, несущее фигуры герба Красноярского сельского поселения: белая чайка, летящая над тремя желтыми домами, стоящими в ряд на зеленой земле красного обрывистого берега».
2.2. Рисунок флага Красноярского сельского поселения приводится в приложении 1 к настоящему Положению, являющемся неотъемлемой частью настоящего Положения.
2.3. Обоснование символики флага Красноярского сельского поселения.
Возле древнего города Симбирска (современный Ульяновск), на левом берегу Волги недалеко друг от друга стояли три села: Королевка, Канава и Нижняя Часовня. В 1950 году на Волге начали строить гидроэлектростанцию. Территория сел должна была стать дном Куйбышевского водохранилища. И в 1952 году все села, попавшие под затопление, были вывезены в другие места.
Села Канава, Королевка и Нижняя Часовня перенесены выше на территорию своих полей. Объединенный поселок назвали «Колхозный», который в настоящее время является административным центром сельского поселения Красноярское.
Село Красный Яр старше поселка Колхозный. Первое упоминание о селе Красный Яр относится к 1681 году из описания путешественника, профессора Римской императорской академии, который оставил такую запись: «Напоследок марта 10 числа отправился из Симбирска к Красному Яру. Продолжали мы путь по Волге, но как по чрезвычайной вышине левого берега, подняться на него было невозможно, то поехали мы еще 5 верст до деревни Крестово Городище».
Крестьяне, скрывавшиеся от преследования за свои религиозные взгляды (старообрядцы), были первыми поселенцами этого села. Село состояло из нескольких десятков деревянных домов. В селе не было даже колодцев и воду возили и носили из Волги, но славилось село ветряными мельницами, которых в селе насчитывалось 11.
Село Красный Яр находится на крутом берегу Волги и свое название получило от крутого обрыва (яра) и красноватого цвета песчаников, слагающих берег, к тому же эти места были очень красивыми (красными).
На территории Чердаклинского района, в состав которого входит Красноярское сельское поселение, на берегу реки Волги расположено несколько домов отдыха, санаториев, турбаз и детских лагерей отдыха. Самые известные расположены около сёл Красный Яр и Архангельское.
В настоящее время Красноярское сельское поселение по существу является местом загородного отдыха жителей областного центра, построивших на территории поселения дачные дома.
Символика флага Красноярского сельского поселения многозначна:
- красный крутой обрывистый берег (яр) – гласно указывает на название поселения и отражает расположение села на высоком берегу Волги;
- три дома – аллегория трех бывших сел, жители которого образовали поселок Колхозный, а также символ многочисленных дачных домов, расположенных на землях поселения;
- чайка – символическое отражение вхождения поселения в состав Чердаклинского района, на флаге которого чайка одна из главных фигур.
Голубой цвет (лазурь) – символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Зеленый цвет символизирует весну, здоровье, природу, молодость и надежду.
Красный цвет (червлень) – символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника.
Желтый цвет (золото) – символ высшей ценности, величия, богатства, урожая.
Белый цвет (серебро) – символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
2.4. Авторская группа.
Идея герба: Константин Моченов (Химки).
Художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва).
Обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

Материалы сайта Красноярского сельского поселения Ульяновской области

Флаг Красноярского внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №8870.