Флаг города Клинцы утверждён Решением Клинцовского городского Совета народных депутатов от 27 сентября 2006 года № 3-1/125 "Об утверждении официального символа г. Клинцы - флага". Описание флага:

"Флаг города представляет собой прямоугольное полотнище. Отношение ширины флага к его длине - 2:3. Флаг города трёхцветный.
В основании флага у древка лазоревый треугольник и две горизонтально расположенные полосы - зелёная и красная.
В центре лазоревого треугольника помещён герб города Клинцы. Высота треугольника - 1/3 от длины флага. Обоснование символики
Треугольник лазоревого цвета символизирует единство государственной федеральной власти, государственной власти Брянской области и муниципальной власти.
Зелёный цвет символизирует связь с природой, прогресс, расцвет города, надежду.
Красный цвет - сплочённость, мужество, самопожертвование, упорство горожан в достижении цели.

По сообщению А.Куприна ("БИАР", г.Москва) 2008

11 отября 2006 года Решением Клинцовского городского совета народных депутатов № 3-1/36 внесены изменения в решение от 27.09.2006 (оба решения утратили силу в 2024 году).

Решением Клинцовского городского Совета народных депутатов от 31 января 2024 года № 7-486 утверждено Положение о гербе и флаге ГО "город Клинцы".

9.1. Описание флага:
"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух равновеликих горизонтальных красной и зелёной полос; в центре полотнища изображено жёлтое кольцо с прямыми внешними зубцами, заполненное красным и накрытое также жёлтыми челноком в пояс и, поверх челнока, бобиной с нитью".

Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны.

9.2. Флаг составлен на основе герба городского округа и повторяет его символику.

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 14717.

По информации И. Афонасенко