Флаг Ильского городского поселения утвержден Решением Совета Ильского городского поселения от 16 декабря 2010 года №98 "О Положении муниципального образования Ильское городское поселение "О флаге Ильского городского поселения Северского района Краснодарского края". Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №6787. Согласно тексту Положения о флаге:

"2. Геральдическое описание и обоснование символики флага Ильского городского поселения
2.1. Описание флага Ильского городского поселения гласит:
«Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из трех горизонтальных полос – зеленой, малиновой и голубой (в отношении 5:1:1) и воспроизводящее фигуры из герба поселения: на зеленой полосе, вплотную к малиновой, желтым цветом воспроизведена гора, уходящая за края полотнища, с вершиной подобной лежащему медведю; на малиново-голубой полосе желтым цветом воспроизведены два стилизованных камня, между которыми воспроизведена черная капля».
2.2. Обоснование символики флага Ильского городского поселения.
Флаг Ильского городского поселения языком символов и аллегорий отражает географические, исторические и другие особенности поселения.
Главной фигурой флага Ильского городского поселения является гора с лежащим на ней медведем – аллегорией Медвежьей горы, расположенной на территории поселения.
Черная капля – символизирует запасы нефти, обнаруженные на землях поселения еще в XIX веке. Нефть, обнаруженная в этих местах, буквально сочилась из земли. Первые поселенцы будущего поселка Ильского просто собирали ее ведрами и использовали для хозяйственных нужд. В 1884 году прямо у дороги, ведущей в станицу Дербентская, была пробурена первая скважина Северского района. Нефть в ней фонтанировала сама. И в настоящее время здесь ведутся работы по бурению скважин, добыче нефти и ее переработке.
Два стилизованных камня – символизируют два населенных пункта, входящих в состав городского поселения (поселок Ильский и станица Дербентская). Они также символизируют добычу строительных материалов (камня, щебня, песка), обеспечивающих нужды городского поселения.
Малиново-голубая полоса имеет двойную символику. Малиновый цвет – символ черноморского казачества, основавшего на Кубани многие станицы, в том числе и станицу Ильскую, ставшей впоследствии поселком. Голубой цвет – символ реки Иль, по имени которой названы поселок и поселение.
Зеленый цвет символизирует весну, здоровье, природу, молодость и надежду.
Малиновый цвет (пурпур) – символ власти, славы, почета, благородства происхождения, древности.
Голубой цвет (лазурь) – символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Черный цвет символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность.
Желтый цвет (золото) – символ урожая, богатства, стабильности, уважения, солнечного тепла и энергии.
2.3. Авторская группа:
идея: Николай Ищенко (ст. Дядьковская), Константин Мочёнов (Химки);
Анатолий Раков (Краснодар);
художник и компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

По сообщению В.Маркова со ссылкой на материалы официального сайта п.г.т. Ильский