Флаг Хайбуллинского района утвержден решением Совета муниципального района Хайбуллинский район Республики Башкортостан от 13 июля 2006 года №Р-12/119. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под №3024, а также - в Государственный регистр символики в Республике Башкортостан под №061. Автор флага - Урал Масалимов. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух горизонтальных полос: верхней голубого цвета шириной 4/5 ширины полотнища и нижней желтого цвета; в центре голубой полосы летящий к древку орел белого цвета с расправленными в стороны крыльями".

Cимволика флага повторяет символику герба, поэтому приведем обоснование символики герба района:

Хайбуллинский район расположен в самой юго-восточной части Башкортостана, на окраине Зилаирского плата.
Большую часть района занимают ковыльные степи необыкновенной красоты. В связи с этим одной из центральных фигур герба является изображение летящего степного орла. Будучи характерным представителем фауны района, олицетворяющим бескрайние степи Башкирского Зауралья, орел одновременно является геральдическим символом целеустремленности, свободолюбия, достоинства, энергии и воли.
Богатые недра района содержат месторождения медно-колчеданных руд и других полезных ископаемых. Золотой пирамидальный орнамент оконечности герба символизирует богатые запасы полезных ископаемых, с разработкой которых связана перспектива дальнейшего экономического развития района и роста уровня жизни населения.
Общеизвестно, что особые климатические условия Хайбуллинского района позволяют выращивать высококачественную пшеницу твердых сортов, имеющую большую ценность в пищевой промышленности. В связи с этим, в центре герба возвышается золотой хлебный колос. Колос также отражает одно из основных направлений экономики района – сельскохозяйственное производство.
Хайбуллинский район знаменит древними историческими памятниками: курганами, легендарной дорогой Канифа, а также интересными природными ландшафтами. Поэтому по сторонам от хлебного колоса расположенные золотые тамги башкирских родов Усерган и Тангаур, с древних времен поселившихся на землях олицетворяют глубокие исторические корни, духовную опору на культуру предков, преемственность поколений, бережно хранящих славную историю и традиции родного края. Лазоревый цвет поля щита герба подчеркивает развитие, движение вперед и, в то же время, является геральдическим символом красоты, величия и верности. Золотой цвет элементов герба символизирует плодородие, благополучие и процветание района.

Материалы сайта Государственного Собрания - Курултая Республики Башкортостан