Город возник из поселения Улала (с 1922 - центр Ойротской автономной области). В 1928 году село Улала получило статус города, в 1932 году переименовано в Ойрот-Тура, а в 1948 году - в Горно-Алтайск.

Флаг Горно-Алтайска утвержден решением Горно-Алтайского городского Совета депутатов №22-3 от 28 января 2020 года. Описание флага:

Прямоугольное полотнище голубого цвета с отношением ширины к длине 2:3, в центре которого изображены фигуры из герба города: положенные в левую перевязь лук, топор с каменным наконечником вниз и копье с каменным наконечником вверх, причем наконечник топора положен поверх остальных фигур; все фигуры жёлтого цвета. Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны.
Флаг составлен на основе герба города и повторяет его символику.

Источник - ГЕРАЛЬДИКА.РУ. Текст документа предоставлен В. Пермяковым

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 12845.

Фото свидетельства прислано В. Пермяковым