Флаг Епишинского сельсовета утвержден решением Епишинского сельского совета депутатов № 20-51р от 9 апреля 2021 года [текст проекта этого решения]. Флаг зарегистрирован в Государственном геральдическом регистре РФ под № 13901.

9.1. Флаг Епишинского сельсовета представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, на котором воспроизводятся фигуры из герба Епишинского сельсовета, выполненные в зелёном, белом, жёлтом и голубом цветах.
Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны.
9.2. Флаг составлен на основе герба муниципального образования и повторяет его символику.

Для справки приведем обоснование символики герба Епишинского сельсовета:

... Село Епишино расположено на правом берегу реки Енисей, который в гербе символизирует лазоревая оконечность, напротив районного центра – города Енисейска. История и развитие Епишино неразрывно связаны с Енисейском. Эту связь в гербе символизируют два соболя, которые также являются основными фигурами гербов Енисейска и Енисейского района.
У Епишино удачное транспортно-географическое расположение – от села на Крайний Север уходит дорога, доходящая до поселка Соврудник, откуда через Епишино на «большую землю» доставляются грузы в виде природных богатств Севера – в первую очередь золота, добываемого в окрестностях Соврудника. А через Енисей до Енисейска от Епишино действует паромная переправа (зимой – зимник). Эту дорогу и паромную переправу в гербе символизирует узкое острие, а природные богатства и расположение на Севере олицетворяет золотая восьмиконечная звезда.
Село Епишино окружает тайга с хвойными деревьями – очень красивыми могучими елями, соснами и кедрами. Охота (заготовка пушнины), рыболовство, шишкобой, сбор лесных ягод и грибов являются основными промыслами местных жителей. Также важную роль в экономике сельсовета занимает заготовка древесины. Окружающую Епишино сибирскую тайгу и лесные богатства в гербе символизируют ели, вырастающие из оконечности.
Применённые в гербе цвета в геральдике обозначают:
– Зелень (зеленый цвет) – традиционный символ лесов и сельского хозяйства. Также зелёный цвет – символ природы, весны, здоровья, жизненного роста.
– Лазурь (голубой, синий цвет) – символ красоты, чести, славы, преданности, истины, добродетели, чистого неба и водных объектов.
– Серебро (белый цвет) – символ чистоты, мудрости, благородства, мира, взаимосотрудничества. Также белый цвет – традиционный цвет Севера и снега.
– Золото (жёлтый цвет) символизирует богатство, справедливость, стабильность, уважение, великодушие.

Источник - информация В. Пермякова и В. Маркова