Флаг Ельнинского городского поселения утверждён Решением Совета депутатов Ельнинского городского поселения от 20 августа 2010 года № 40а и внесён в Государственный геральдический регистр РФ под №6717. Описание флага:

"Прямоугольное белое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее изображение трёх зелёных с чёрными стволами елей, и вдоль нижнего края — зелёную полосу в 1/5 полотнища, при этом ели отчасти расположены на фоне полосы и как бы вырастают из неё". Обоснование символики
Флаг разработан на основе герба Ельнинского городского поселения, основой которого является исторический герб города Ельня Смоленского наместничества, Высочайше утверждённый 10 (21) октября 1780 года, описание которого гласит: В верхней части щита герб Смоленский: в серебряном поле черная пушка на золотом лафете, а на пушке райская птица. В нижней — три дерева ели в белом поле, означающия имя сего города.
Восстановление исторического герба города для современного Ельнинского городского поселения подчёркивает историческую, культурную и геральдическую преемственность, неразрывную связь многих поколений жителей города; показывает внимательное отношение ельнинцев к своему наследию.
28 июля 1981 года город Ельня был награждён орденом Отечественной войны I степени. В Указе Президиума Верховного Совета СССР говорилось, что этой награды город удостоен «за мужество и стойкость, проявленные защитниками города в годы Великой Отечественной войны, активное участие трудящихся в партизанском движении и успехи, достигнутые в хозяйственном и культурном строительстве». Орденская лента, которая может крепиться к древку флага, подчёркивает значительные заслуги города.
Белый цвет (серебро) — символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Зелёный цвет — символ природы, здоровья, молодости, развития.
Чёрный цвет — символ плодородия, скромности, мудрости.

Источник - Википедия. страница "флаг Ельни"