Флаг района утвержден решением Совета муниципального района Дюртюлинский район Республики Башкортостан от 11 июля 2006 года № 71 "О флаге муниципального района Дюртюлинский район Республики Башкортостан", внесен в Государственный регистр символики в Республике Башкортостан с присвоением регистрационного №017 и в Государственный геральдический регистр Российской Федерации с присвоением регистрационного №2977. Авторы: Фарит Галлямов, Равиль Давлетов. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище зеленого цвета с соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Дюртюлинского района в зеленом, желтом, синем, черном и белом цветах".

"В основу композиции герба Дюртюлинского района легли особенности экономического и исторического развития края.
По берегам реки Белой (Агидели), вокруг величественной горы Туратау, а также в степной зоне, на сарманайских целинных землях, привольно паслись табуны лошадей, стада молочных коров, а в густых лесах водились разные пушные звери. Плодородие земель края способствовало развитию земледелия, а удобное географическое положение на водных и сухопутных торговых путях – образованию новых населенных пунктов и благополучию населения. К началу ХХ века с пристани на реке Агидели отправлялось свыше миллиона пудов различных грузов, в основном хлеб и лес. Поэтому центральной фигурой герба являются четыре золотых колоса, символизирующие богатство, благополучие и достоинство народа, достигнутое трудолюбием, настойчивостью, любовью к малой родине и стремлением к знаниям. В знак высокой духовности народа и динамичного развития района остья колосьев устремлены ввысь. Четыре колоса также символически отражают название района «Дюртюли» – четырехдомный. Зеленое поле герба созвучно бескрайним полям и лесным массивам – главному богатству края. Одновременно зеленый цвет символизирует изобилие, плодородие, радость, покой и мир.
Лазурные волны олицетворяют реку Агидель – главную водную артерию района. Также лазурный цвет – символ красоты, величия, безупречности, надежды и мечты.
Черный цвет в оконечности герба символизирует тучные
черноземы дюртюлинского края, а также нефть, "черное золото", с которыми неразрывно связано становление и развитие района"

Материалы книги "Башкоротостан. Государственные символы и символика городов и районов", Уфа, 2007 г.

Вообще первоначально решением Совета муниципального района от 11.07.2006 года № 71 было утверждено такое описание флага:

"На зелёном поле флага в верхнем левом углу четыре колоса жёлтого цвета по 9 зёрен в каждом. Вдоль древка пять гребней голубой волны, окаймлённой белым цветом, выпуклой стороной к древку".

Но в ходе консультаций с Геральдическим советом и описание, и рисунок флага были изменены, при этом номер решения не менялся.

По информации В. Пермякова. Примерная реконструкция рисунка флага выполнена для "Вексиллографии" Ф. Шмидтом