Флаг Челнавского сельсовета утвержден решением Челнавского сельского Совета народных депутатов от 31 мая 2016 года № 122 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11031. Описание флага:

"Описание флага:
"Прямоугольное двухстороннее полотнище белого цвета с отношением ширины к длине 2:3, на котором изображены фигуры из герба Челнавского сельсовета, выполненные голубым, жёлтым, чёрным, зелёным, белым и красным цветом".
Обоснование символики флага Челнавского сельсовета.
Административный центр сельсовета - село Селезни (в прошлом Солдатская слобода) основанного во второй половине XVII века служилыми людьми в период строительства земляного вала бывшей Белгородской укреплённой сторожевой черты, построенной по указу царя Михаила Романова для защиты от набегов татар. По словам жителей, село получило свое название от того, что здесь было много диких уток, так как село Селезни расположено в долине реки Челновой.
Символика фигур, изображённых на флаге Челнавского сельсовета, многозначна:
- два селезня - гласный символ села Селезни;
- два селезня - два населенных пункта: с. Селезни, д. Малиновка 2-я, входящих в состав Челнавского сельсовета.
- чёлн - гласный символ названия Челнавского сельсовета, аллегорически символизирует реку Челновую, протекающую по территории поселения и давшую ему название. Название реки, по всей видимости, происходит от слова чёлн (старинное славянское название лодки).
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
Голубой цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности,возрождения.
Жёлтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая.
Черный цвет символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность.
Малиновый цвет (пурпур) - символ власти, славы, почета, благородства происхождения, древности.
Красный цвет (червлень) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника.
Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (Химки), Сергей Янов (пгт Малаховка);
художник и компьютерный дизайн: Наталья Кудря (Москва);
обоснование символики: Сергей Янов (пгт Малаховка).

По материалам сайта Союза геральдистов России