Флаг Частоозерского сельсовета утверждён Решением Частоозерской сельской Думы от 14 декабря 2017 года № 27. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11766.

2.1. Описание флага Частоозерского сельсовета:
"Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры из герба Частоозерского сельсовета, изображённые жёлтым, красным, зеленым, синим и белым цветом".
2.2. Рисунок флага Частоозерского сельсовета приводится в приложении 1 к настоящему Положению, являющемся неотъемлемой частью настоящего Положения.
2.3. Обоснование символики флага Частоозерского сельсовета.
Флаг Частоозерского сельсовета составлен на основе герба Частоозерского сельсовета и повторяет его символику, отражая его историю, окрестности и основную производственную деятельность местных жителей.
Село Частоозерье – основа и центр муниципального образования Частоозерский сельсовет. Селу более 300 лет и за это время свиноводство, да и животноводство в целом - основная часть хозяйства местного населения. Наиболее характерным и узнаваемым символом жизнедеятельности для Частоозерья является свиноводство. Не рыбалка или охота, а именно свиноводство. Настолько, что в селе собираются ставить памятник свинье. В общем, свинья здесь в большом почете. Именно эта, подчеркивающая и составляющая основу жизни села, особенность стала основой герба Частоозерского сельсовета – поросенок в красном поле, цвет которого перекликается с цветом товарного знака свинокомплекса "Велес" – ведущего современного предприятия по производству и переработке свинины.
Кроме символа мясной промышленности, поросенок имеет значения силы, процветания, благополучия, удачи и просто веселья.
Многократное разделение каймы герба на серебро (белый цвет) и лазурь (синий цвет) – аллегорическое обозначение окрестностей села с большим количеством озер, которые и дали название селу – Частоозерье, что делает герб полугласным.
Примененные во флаге цвета символизируют:
Красный цвет (червлень) – символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника.
Зелёный цвет символизирует территории, освоенные жителями для жилья и нужд сельского хозяйства и природные леса и луга. Зеленый цвет - символ весны, здоровья, молодости и надежды.
Синий цвет (лазурь) -символ воды, водоемов и неба; символ возвышенных устремлений и благородства.
Желтый цвет (золото) – символ высшей ценности, величия, богатства, урожая.
Белый цвет (серебро) – символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
2.4. Авторская группа.
Идея флага Павел Бережной (с.Частоозерье), Константин Моченов (Химки).
Художник и компьютерный дизайн: Анна Гарсия (Москва).
Обоснование символики: Константин Моченов (Химки).

По информации В. Пермякова