Флаг Байгильдинского сельского поселения утвержден Решением собрания депутатов Байгильдинского сельского поселения Канашского района от 29 октября 2014 года № 49/1 "Об утверждении муниципальных символов (герба и флага) Байгильдинского сельского поселения Канашского района Чувашской Республики". Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 10127. Согласно тексту Положения о флаге:

3.1. Описание Флага поселения:
Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Байгильдинского сельского поселения Канашского района в желтом, красном и зеленом цветах.

Для справки приводим описание и обоснование символики герба из Положения о гербе:

3.1. Геральдическое описание Герба муниципального образования:
В золотом поле три ствола с корнями: средний зеленый длиннее, по сторонам – червленые.
В вольной части – законодательно установленная символика Чувашской Республики».
Герб Байгильдинского сельского поселения Канашского района Чувашской Республики в соответствии с Методическими рекомендациями по разработке и использованию официальных символов муниципальных образований (Раздел 2, Глава VIII, п.п. 45-46), утверждёнными Геральдическим советом при Президенте Российской Федерации 28.06.2006 года может воспроизводиться со статусной короной установленного образца.
3.2. Обоснование символики Герба муниципального образования:
В состав Байгильдинского сельского поселения входят три деревни: Новые Мамеи, Байгильдино и Туруново. По его территории протекает река Малый Цивиль и речки Оженарка и Пурамар.
Эти географические и природные особенности легли в основу герба, символика которого многозначна:
три ствола дерева обозначают три деревни и три реки.
Корни – символ связи с землей, семьей. «Человек, имеющий корни», – говорят о тех людях, которые твердо стоят на ногах. «Смотреть в корень» – обращать внимание на самое существенное, вникать в суть.
Корни деревьев, уходящие глубоко в землю, указывают на уважительное отношение жителей поселения к традициям и истории родной земли.
Золотой (желтый) цвет поля щита повторяет цвет Государственного флага Чувашии.
Красный цвет – символ мужества, трудолюбия и любви.
Зеленый цвет олицетворяет природу, плодородие и жизненную силу

По сообщению В. Пермякова. Рисунок предоставлен В. Шипуновым