Флаг Аркинского сельского поселения утвержден решением Аркинского сельского Совета народных депутатов от 14 февраля 2018 года № 3-148 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11750. Описание флага:

"Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры герба Аркинского сельского поселения, выполненные малиновым, желтым, белыми и синим цветом".

Обоснование символики флага Аркинского сельского поселения.
Флаг Аркинского сельского поселения составлен на основании герба Аркинского сельского поселения и повторяет его символику.
Аркинское сельское поселение образовано в результате проведения муниципальной реформы в 2005 году, путём слияния двух сельсоветов: Аркинского и Лубошевского. Это образование языком символов и аллегорий показано двумя равными частями флага.
Большую часть территории Аркинского сельского поселения занимают поля, на которых выращивают зерновые культуры и картофель, что символически показано цветами картофеля. Количество цветов - восемь, точно совпадает с количеством населенных пунктов поселения: села Аркино и Лубошево (бывшие центры сельсоветов аллегорически показаны двумя цветками картофеля, изображенными цветами переменными с цветами поля); деревня Добровольская; поселки Бугры, Ивановский, Нововолубошево, Подыивановский и ж/д станция Аркино. Многие из них имеют богатую историю и древнее происхождение:
- центр поселения село Аркино (историческое название - Аркинь, Оркинь) упоминается с начала XVII века в составе Брасовского стана Комарицкой волости как существующее село с Никитской церковью;
- село Лубошево (Лубошева, устаревшее Лубоша, Лубышево) упоминается с 1620-х годов в составе Брасовского стана Комарицкой волости как существующее село с храмом Флора и Лавра;
- деревня Добровольская (до 1964 - 3агрядская) упоминается с 1700-х годов;
- поселок Ивановский - ранее, в XVIII веке на этом месте существовала деревня Ивановка, позднее исчезнувшая (входила в Севский уезд; в 1778-1782 - во временном образованном Луганском уезде). Со второй половины XIX века - Ивановский хутор, где действовал винзавод (в ХХ веке - спиртзавод);
- поселок Новолубошево (Новое Лубошево) основан во второй половине XIX века как выселки из деревни Загрядской (первоначальное название - Новогеоргиевская слобода, Новогеоргиевский поселок).
Оба поля флага объединены синим диском. Синий диск с волнистыми краями и золотым карпом символизируют озеро - самое большое в Комаричском районе озеро, в котором водится много рыбы.
Применённые во флаге цвета символизируют:
Пурпур - символ древнего происхождения, достоинства и уважения.
Синий цвет (лазурь) - мир, искренность, честь, славу, преданность, истину и добродетель.
Жёлтый цвет (золото) - символ почета, солнечного света, стабильности, богатства и урожая;
Белый цвет (серебро) - символ совершенства, благородства, чистоты, веры, мира.
Авторская группа:
Идея флага: Константин Моченов (Химки), Татьяна Мякотина (с.Аркино);
Художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
Обоснование символики: Константин Моченов (Химки).

По материалам сайта Союза геральдистов России