Рокишкис (Rokiškis) получил права города в 1920 году. Ныне Рокишкис - центр Рокишкского городского староства, а также - Самоуправления Рокишкского района в Паневежском уезде.

Флаг Рокишкиса повторяет сюжет герба, утверждённого в 1993 году. На флаге изображены эмблемы из гербов бывших владельцев города: канделябр семьи Крошинских, бык Тизенхаусов, бруски и лилия Пржездзецких. В одном из полей изображён орган, символизирующий богатые музыкальные традиции.

Использован рисунок В.Мисюнаса для сайта Flags of the World